Les avantages fondamentaux d’un MSR ont leur origine dans l’utilisation d’un combustible liquide. Le coût d’un système d’énergie nucléaire est essentiellement une fonction de son profil intrinsèque de sûreté. Plus l’arbre de défaillances est grand, plus il est nécessaire d’ajouter des systèmes complexes pour gérer les dangers. Le paradigme actuel dans le nucléaire est d’accepter ces dangers et travailler pour réduire les risques (la probabilité d’un incident), ce qui fait augmenter le coût. Un MSR élimine certains dangers à la source, permettant un élagage de l’arbre de défaillances, une simplification de la conception, et une réduction du coût. Tout ceci fait que le MSR est beaucoup plus compacte que les réacteurs nucléaires actuels, avec des coûts en matériaux et construction bien moindres. D’autres avantages existent dans la meilleure consommation du combustible et une température d’exploitation élevée.